空腹吃木瓜是不会有太大问题的，但是不能吃太多。
木瓜不像柿子、番茄，番茄味酸，如果空腹使用容易造成胃酸分泌过多，也不像香蕉，香蕉富含钾镁元素，空腹吃容易造成心率不齐。一般来说，正常人空腹吃是没有问题的，甚至空腹吃还具有清宿便、促消化的功效，对治便秘是有一定作用的。但糖尿病患者是不能够空腹吃的，因为木瓜的糖分比较高，对于那些糖耐量异常者来说，空腹吃是十分不科学的。建议可以将牛奶与木瓜搭配到一起食用，可以将木瓜的功效与牛奶结合，，更加对自己的身体好的。
但是需要注意的是，木瓜中仍然含有一定量的草酸，如果空腹食用还是会刺激胃酸分泌的。如果胃本来就不太好，空腹吃木瓜就很容易造成胃炎等问题。所以，对于爱美女士来说，尽量还是不要空腹吃木瓜，同时也要注意不要过量吃。
一般来说，吃木瓜最好的时间是饭后半个小时到一个小时，还有助于消化。