不适合服用褪黑激素的人群主要包括肝功能不全、肾功能不全、孕妇、心脑血管疾病、酒精过敏、青少年、儿童和婴儿。褪黑素虽然是保健品，有调节大脑生物钟的作用，但并不是所有人都适合，所以使用不当会引起不良反应。以上人群应尽量避免使用褪黑激素，因为褪黑激素对肝肾功能有一定的影响，同时也会影响到怀孕期间的女性，因为它会影响激素水平的变化。
同时，对于部分抑郁症患者，尽量不要服用褪黑激素，长期服用会导致抑郁症加重。因此，尽量多吃新鲜水果和蔬菜，避免吃生冷刺激性食物。另外，白天要保证良好的睡眠习惯和适当的运动，以达到最佳的睡眠状态，这样就不需要褪黑激素了。