煮沸的玉米须水的副作用主要是由长期饮用引起的，这可能会加重肾脏负担、低血糖、营养吸收障碍或手脚痉挛。
目前，临床上使用的玉米须开水主要是利尿、增加尿量、帮助减轻水肿，它还可以清热利湿、降低血压，对尿路感染也有一定的治疗作用。因此，临床上可用于治疗水肿、高血压、肾盂肾炎等疾病。一般来说，用玉米在短时间内烧水不会造成明显的副作用。
然而，如果长期饮用与玉米一起煮的水，可能会增加肾脏负担，并导致肾功能不全的副作用。它还可能影响血糖代谢，导致低血糖。长期饮酒会影响身体对营养素的充分吸收，从而可能导致营养不良。长时间饮用玉米和沸水也可能会增加身体的钾排泄，导致低钾性手足抽搐。